داستان در ژاپن و در آستانه سال 1997 جریان دارد، زمانی که مالکوم لی، یک دانشمند برجسته در حال توسعه یک سیستم هوش مصنوعی است که به‌عنوان رقیبی قدرتمند برای Skynet طراحی شد. به‌منظور جلوگیری از تهدیدهای آینده، لی و سه فرزندش هدف یک قاتل سایبرنتیک ناشناس قرار می‌گیرند که از آینده به گذشته آمده است. برای محافظت از این خانواده و جلوگیری از شکست در آینده، یک سرباز مقاومت از سال 2022 به نام ایکو به گذشته فرستاده می‌شود. این سرباز باید از مالکوم و خانواده‌اش در برابر تهدیدات محافظت کند و از پرتاب “کوکورو” که یک هوش مصنوعی پیشرفته است، جلوگیری نماید.